Linear-time prediction of proteome-scale microbial protein interactions

Le framework FlashPPI, basé sur l'apprentissage contrastif et les modèles de langage génomique, permet une prédiction linéaire des interactions protéiques à l'échelle du protéome microbien avec une précision comparable aux modèles de repliement structurel mais à une fraction du coût computationnel, le tout accessible via la plateforme web seqhub.org.

Cornman, A., Tranzillo, M., Zulaybar, N. G. + 2 more2026-03-02📄 molecular biology

Spatial organization of myofibroblastic and complement-secreting CAFs in neuroendocrine tumors

Cette étude démontre que les tumeurs neuroendocrines, malgré leur diversité anatomique, partagent une architecture stromale conservée mais spatialement ségréguée, caractérisée par la dominance de fibroblastes associés au cancer de deux types distincts : des myofibroblastes enrichis dans les régions denses en collagène et des fibroblastes sécrétant le complément localisés aux interfaces tumorales.

Niedra, H., Springe, M. L., Tiltina, K. + 10 more2026-03-01📄 molecular biology

A full-length single nuclei transcriptomic atlas of human skeletal muscle insulin resistance

Cette étude établit une carte transcriptomique complète des noyaux individuels du muscle squelettique humain, révélant que l'insulinorésistance est un processus multicellulaire complexe où des populations nucléaires spécifiques, notamment les noyaux MYH7B+ et EGF+, régulent distinctement la sensibilité à l'insuline via des mécanismes impliquant le transporteur ZIP14 et la signalisation EGF.

Whytock, K. L., Divoux, A., Vazquez, J. + 14 more2026-02-28📄 molecular biology

Modeling Sex Differences and Neurodegeneration in Repetitive Traumatic Brain Injury Using Drosophila

Cette étude présente un modèle amélioré de lésion cérébrale traumatique répétitive chez la drosophile, capable de reproduire des déficits comportementaux, des altérations protéomiques et une neurodégénérescence sexospécifiques, offrant ainsi un outil précieux pour comprendre les mécanismes sous-jacents aux conséquences à long terme des traumatismes crâniens répétés.

Katchur, N. J., Yeager, J., Savas, H. + 2 more2026-02-28📄 molecular biology

Fully Phased Telomere-to-Telomere Assemblies for Thoroughbred Horse and Donkey Haplotypes derived from a Mule Illuminate the Peculiar Evolution of Equid Centromeres

Cet article présente des assemblages génomiques complets de type télo-mère à télo-mère pour un cheval pur-sang et un âne, dérivés d'un mulet, qui révèlent une plasticité centromérique inédite chez les équidés, notamment l'absence de liaison entre CENP-B et CENP-A, offrant ainsi des ressources fondamentales pour comprendre leur évolution chromosomique accélérée.

Li, K., Cappelletti, E., Dessaix, C. + 28 more2026-02-27📄 molecular biology

Epigenetic regulation of TERRA transcription, R-loop formation, telomere integrity and metacyclogenesis by base J in Leishmania major.

Cette étude démontre que chez *Leishmania major*, la base J régule l'épigénétique en contrôlant la transcription par l'ARN polymérase II des TERRA aux télomères, un mécanisme essentiel au maintien de l'intégrité télomérique, à la viabilité cellulaire et à la différenciation en métacycles infectieux.

Kieft, R., Sabatini, R.2026-02-26📄 molecular biology

Synergistic Notch-WNT Activation Underlies Pediatric Dilated Cardiomyopathy

Cette étude démontre que la réactivation pathologique synergique des voies de signalisation Notch et WNT, spécifique aux cardiomyopathies dilatées pédiatriques, entraîne un remodelage cardiaque délétère et une rigidité myocardique, suggérant que l'inhibition de cette voie constitue une stratégie thérapeutique adaptée à l'âge.

Nyarko, O. O., Rausch, E., Goff, J. R. H. + 11 more2026-02-26📄 molecular biology

Antagonist binding actively disrupts interleukin-1 receptor dynamics to block co-receptor recruitment

En combinant des simulations de dynamique moléculaire à l'échelle atomique et une modélisation de la flexibilité, cette étude révèle que la liaison d'un antagoniste au récepteur IL1R1 bloque activement le recrutement du co-récepteur en augmentant la flexibilité du domaine D3, démontrant ainsi que l'antagonisme est un processus allostérique piloté par la dynamique plutôt qu'une simple incapacité à stabiliser une conformation active.

Nithin, C., Fasemire, A., Kmiecik, S.2026-02-26📄 molecular biology

HIF-1α coordinates adrenal steroidogenesis through direct transcriptional control and regulation of miRNA biogenesis

Cette étude révèle que HIF-1α coordonne la stéroïdogénèse surrénalienne en régulant à la fois directement la transcription des enzymes clés et en modulant l'expression des gènes de la biogenèse des miARN pour façonner le paysage de régulation post-transcriptionnelle en réponse à l'hypoxie.

Stepien, B. K., Sinha, A., Ariyeloye, S. + 4 more2026-02-26📄 molecular biology

Molecular Diversity and Recombination Patterns of the ORF7 (Nucleocapsid) Gene in Betaarterivirus americense Variants Circulating from Lima, Peru

Cette étude caractérise la diversité génétique et les événements de recombinaison du gène ORF7 de dix souches de PRRSV-2 circulant à Lima, au Pérou, révélant la co-circulation de deux lignées distinctes et la présence d'une recombinaison inter-lignées avec des implications potentielles pour les épitopes B.

Cotaquispe, R. Y.2026-02-26📄 molecular biology

Longitudinal in vivo human wound healing model defines key role for smooth muscle cells in ECM remodeling

Cette étude établit un modèle de cicatrisation cutanée humaine in vivo démontrant que les cellules musculaires lisses, via l'induction de TIMP1, sont les principaux moteurs du remodelage de la matrice extracellulaire nécessaire à la guérison, tandis que leur dysfonctionnement explique l'échec de cicatrisation observé dans les ulcères diabétiques.

Emmerich, K., Suri, R., Yang, D. + 14 more2026-02-26📄 molecular biology

Unified function of FACT in mammalian chromatin replication and transcription, dissolving and restoring nucleosomes to counteract genome aggregation

Cette étude démontre que le chaperon histonique FACT est essentiel chez les mammifères pour orchestrer la réplication et la transcription en assurant la dissolution et la réassemblage dynamiques des nucléosomes, prévenant ainsi l'effondrement de la structure chromatinienne et l'agrégation aberrante du génome.

Frater, R. C. M., Jensen, R. R., Olle Lopez, J. + 12 more2026-02-26📄 molecular biology